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醫藥物流作為一個復雜的系統工程，決不是一蹴而就的。

首先它取決于先進的信息、網絡系統。在傳統企業內，由于信息化管理的要求，還需對之進行企業內流程再造以及組織結構創新，因為信息化追求的是整體最優，而非局部最優。其次它還受到社會公共基礎設施、政策法規等宏觀因素的制約，也有賴于企業人才、資金、管理等微觀因素的支持。因而需要醫藥行業端正觀念，從傳統的“運輸加倉儲”思維模式中解放出來，深刻理解物流運作的內涵及面臨的潛在問題，實施戰略性物流系統。

要發展中國醫藥物流，必須首先從宏觀上建設與培育醫藥物流市場，并使這一市場逐步規范化、法制化。為此，應著力于打破地方保護主義，使醫藥物流市場在競爭環境中形成，同時政府應出臺相應的法律進行保護，出臺醫藥物流的發展政策。

根據藥品管理法制訂醫藥物流各項實施細則，堵塞藥品在流通過程中的管理漏洞，進一步提高宏觀調控能力。醫藥市場必須是一個有序、有效的市場，而無序的、無效的競爭，都將影響醫藥市場的規范經營。

擴大監控力度，剝離低效的醫藥物流部門，逐步實現企業物流活動的社會化，為醫藥物流市場發展培育廣泛而堅實的市場需求。建立嚴格的醫藥物流市場的準入制度，限制不合格者進入醫藥物流市場，控制惡性競爭。

加大投資進行醫藥物流基礎設施的改造和新建，充分利用好國債資金、國外資金發展醫藥物流；調整醫藥物流服務配送中心的許可證制度和經營對象范圍，應與國際接軌，建立配送中心嚴格準入的許可證制度，建立配送中心下屬的配送中心的許可證備案制度，應允許配送中心既可以向自己品牌的網絡終端配送，也允許向社會藥店、診所、醫院配送，以提高配送中心的效益；加快縣級醫藥公司改造成醫藥配送中心的建設。

積極發揮政府在推動醫藥物流中的作用。首先，政府各部門間的政策應該相互銜接；其次，需要政府制訂相應的行業標準及行業法規，協助行業制訂物流標準化工作。藥品編碼的標準化，物流作業中使用的設備、包裝、運輸、裝卸工具、使用的托盤等標準化，這些都需要政府加以引導與督促；再次，需要政府提供資金、稅收方面的扶持。如政府批準了11個由國債貼息的醫藥物流中心建設項目，國藥物流、重慶和平藥房、廣州醫藥公司等企業籌建的物流中心都位列其中。